MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72

Total Repeats: 1398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017205	AAG	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189585
2	NC_017205	GAA	2	6	430	435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189585
3	NC_017205	AG	3	6	461	466	50 %	0 %	50 %	0 %	384189585
4	NC_017205	ATT	2	6	474	479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189585
5	NC_017205	AATT	2	8	570	577	50 %	50 %	0 %	0 %	384189585
6	NC_017205	AATG	2	8	599	606	50 %	25 %	25 %	0 %	384189585
7	NC_017205	ATT	2	6	609	614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189585
8	NC_017205	TCA	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189585
9	NC_017205	AAG	2	6	686	691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189585
10	NC_017205	AAAAG	2	10	696	705	80 %	0 %	20 %	0 %	384189585
11	NC_017205	TGC	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189586
12	NC_017205	GAAA	2	8	1449	1456	75 %	0 %	25 %	0 %	384189586
13	NC_017205	AATT	2	8	1468	1475	50 %	50 %	0 %	0 %	384189586
14	NC_017205	TAA	2	6	1825	1830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189587
15	NC_017205	TCA	2	6	1853	1858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189587
16	NC_017205	TGT	2	6	1901	1906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189587
17	NC_017205	GTA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189587
18	NC_017205	TCT	2	6	2057	2062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189587
19	NC_017205	CTT	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189587
20	NC_017205	ATG	2	6	2114	2119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189587
21	NC_017205	TAA	2	6	2135	2140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
22	NC_017205	T	7	7	2159	2165	0 %	100 %	0 %	0 %	384189588
23	NC_017205	C	6	6	2174	2179	0 %	0 %	0 %	100 %	384189588
24	NC_017205	TGA	2	6	2216	2221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189588
25	NC_017205	TTC	2	6	2286	2291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189588
26	NC_017205	CA	3	6	2318	2323	50 %	0 %	0 %	50 %	384189588
27	NC_017205	ACA	2	6	2371	2376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189588
28	NC_017205	CCTT	2	8	2386	2393	0 %	50 %	0 %	50 %	384189588
29	NC_017205	TA	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
30	NC_017205	CATTT	2	10	2484	2493	20 %	60 %	0 %	20 %	384189588
31	NC_017205	T	6	6	2532	2537	0 %	100 %	0 %	0 %	384189588
32	NC_017205	ATC	2	6	2571	2576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189588
33	NC_017205	ATTC	2	8	2646	2653	25 %	50 %	0 %	25 %	384189588
34	NC_017205	GATA	2	8	2708	2715	50 %	25 %	25 %	0 %	384189588
35	NC_017205	TGT	2	6	2735	2740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189588
36	NC_017205	AT	3	6	2771	2776	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
37	NC_017205	ATT	2	6	2841	2846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189588
38	NC_017205	AAT	2	6	2889	2894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
39	NC_017205	TGT	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189588
40	NC_017205	ATA	2	6	2964	2969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
41	NC_017205	AT	3	6	3067	3072	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
42	NC_017205	TCA	2	6	3106	3111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189588
43	NC_017205	TAA	2	6	3123	3128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
44	NC_017205	AT	3	6	3160	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
45	NC_017205	GAA	2	6	3213	3218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189588
46	NC_017205	GTA	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189588
47	NC_017205	GTAA	2	8	3266	3273	50 %	25 %	25 %	0 %	384189588
48	NC_017205	AAT	2	6	3299	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
49	NC_017205	TAA	2	6	3351	3356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
50	NC_017205	ATA	2	6	3408	3413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
51	NC_017205	ATG	2	6	3464	3469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189588
52	NC_017205	GGAT	2	8	3525	3532	25 %	25 %	50 %	0 %	384189588
53	NC_017205	AT	3	6	3608	3613	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
54	NC_017205	CTCTT	2	10	3624	3633	0 %	60 %	0 %	40 %	384189588
55	NC_017205	A	7	7	3672	3678	100 %	0 %	0 %	0 %	384189588
56	NC_017205	ATTA	2	8	3732	3739	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
57	NC_017205	TGTT	2	8	3808	3815	0 %	75 %	25 %	0 %	384189588
58	NC_017205	A	6	6	3817	3822	100 %	0 %	0 %	0 %	384189588
59	NC_017205	AGAA	2	8	3929	3936	75 %	0 %	25 %	0 %	384189588
60	NC_017205	ATG	2	6	3938	3943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189588
61	NC_017205	T	7	7	3956	3962	0 %	100 %	0 %	0 %	384189588
62	NC_017205	GAA	2	6	3999	4004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189588
63	NC_017205	CA	3	6	4021	4026	50 %	0 %	0 %	50 %	384189588
64	NC_017205	T	6	6	4068	4073	0 %	100 %	0 %	0 %	384189588
65	NC_017205	TTAC	2	8	4105	4112	25 %	50 %	0 %	25 %	384189588
66	NC_017205	TCG	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189589
67	NC_017205	T	6	6	4142	4147	0 %	100 %	0 %	0 %	384189589
68	NC_017205	TCT	2	6	4167	4172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189589
69	NC_017205	ACAT	2	8	4197	4204	50 %	25 %	0 %	25 %	384189589
70	NC_017205	TAG	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189589
71	NC_017205	GC	3	6	4236	4241	0 %	0 %	50 %	50 %	384189589
72	NC_017205	GAG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189589
73	NC_017205	TGA	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189589
74	NC_017205	ATCT	2	8	4430	4437	25 %	50 %	0 %	25 %	384189589
75	NC_017205	TGTA	2	8	4442	4449	25 %	50 %	25 %	0 %	384189589
76	NC_017205	CCG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189589
77	NC_017205	ACA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189589
78	NC_017205	ATG	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189589
79	NC_017205	T	6	6	4833	4838	0 %	100 %	0 %	0 %	384189589
80	NC_017205	CTT	2	6	4940	4945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189589
81	NC_017205	AGCT	2	8	5012	5019	25 %	25 %	25 %	25 %	384189589
82	NC_017205	TAT	2	6	5125	5130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189589
83	NC_017205	TCA	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189589
84	NC_017205	TTA	2	6	5202	5207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189589
85	NC_017205	GGGAT	2	10	5754	5763	20 %	20 %	60 %	0 %	384189590
86	NC_017205	TTTG	2	8	5816	5823	0 %	75 %	25 %	0 %	384189590
87	NC_017205	CTT	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189590
88	NC_017205	GAA	3	9	5868	5876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189590
89	NC_017205	AAG	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189590
90	NC_017205	TGT	2	6	5912	5917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189590
91	NC_017205	GAA	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189590
92	NC_017205	AGT	2	6	5951	5956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189590
93	NC_017205	GATATT	2	12	5958	5969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384189590
94	NC_017205	GAA	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189590
95	NC_017205	ACC	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189590
96	NC_017205	AGAA	2	8	6101	6108	75 %	0 %	25 %	0 %	384189590
97	NC_017205	TAT	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189590
98	NC_017205	AGC	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189590
99	NC_017205	GATTA	2	10	6209	6218	40 %	40 %	20 %	0 %	384189590
100	NC_017205	TAATT	2	10	6230	6239	40 %	60 %	0 %	0 %	384189590
101	NC_017205	GCTT	2	8	6254	6261	0 %	50 %	25 %	25 %	384189590
102	NC_017205	GAA	3	9	6285	6293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189590
103	NC_017205	AAC	2	6	6795	6800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189591
104	NC_017205	GTTT	2	8	6815	6822	0 %	75 %	25 %	0 %	384189591
105	NC_017205	TCT	2	6	6850	6855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189591
106	NC_017205	T	7	7	6859	6865	0 %	100 %	0 %	0 %	384189591
107	NC_017205	G	7	7	6906	6912	0 %	0 %	100 %	0 %	384189591
108	NC_017205	TTAT	2	8	6931	6938	25 %	75 %	0 %	0 %	384189591
109	NC_017205	ATT	2	6	6964	6969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189591
110	NC_017205	TAT	2	6	6989	6994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189591
111	NC_017205	TGG	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189592
112	NC_017205	ATT	2	6	7517	7522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189592
113	NC_017205	ATAAAA	2	12	7524	7535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384189592
114	NC_017205	TAG	2	6	7537	7542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189592
115	NC_017205	CTA	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189592
116	NC_017205	AGAGG	2	10	7606	7615	40 %	0 %	60 %	0 %	384189592
117	NC_017205	CAG	2	6	7626	7631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189592
118	NC_017205	GTA	2	6	7634	7639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189592
119	NC_017205	ATA	2	6	7683	7688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189592
120	NC_017205	TTA	2	6	7695	7700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189592
121	NC_017205	CAG	2	6	7785	7790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189592
122	NC_017205	AT	3	6	7850	7855	50 %	50 %	0 %	0 %	384189592
123	NC_017205	TGA	2	6	7906	7911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189592
124	NC_017205	ATA	2	6	7912	7917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189592
125	NC_017205	TTTA	2	8	8005	8012	25 %	75 %	0 %	0 %	384189593
126	NC_017205	A	8	8	8031	8038	100 %	0 %	0 %	0 %	384189593
127	NC_017205	ACA	2	6	8088	8093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189593
128	NC_017205	AGA	2	6	8111	8116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189593
129	NC_017205	A	6	6	8116	8121	100 %	0 %	0 %	0 %	384189593
130	NC_017205	CAT	2	6	8133	8138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189593
131	NC_017205	AG	3	6	8232	8237	50 %	0 %	50 %	0 %	384189593
132	NC_017205	GTT	2	6	8247	8252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189593
133	NC_017205	AGA	3	9	8276	8284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189593
134	NC_017205	A	6	6	8308	8313	100 %	0 %	0 %	0 %	384189593
135	NC_017205	TCT	2	6	8327	8332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189593
136	NC_017205	GCA	2	6	8352	8357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189593
137	NC_017205	A	8	8	8357	8364	100 %	0 %	0 %	0 %	384189593
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